生物菌剂种类繁多，根据功能不同，市场上常见的生物菌剂主要有两类：一类是以腐熟粪肥为主的生物菌剂，主要包括酵母菌、乳酸菌、嗜热菌等；另一类是以防病为主的生物菌剂，主要包括枯草芽孢杆菌、木霉菌、放线菌等。高温闷棚前后，菜农的使用目的不一样，选择的生物菌种也存在很大差异。

　　闷棚前

　　闷棚前使用的生物菌剂，应该以促进粪肥腐熟、改良土壤为主要目的，此时应该选择以酵母菌、乳酸菌、嗜热菌等多种生物菌组成的复合菌剂，不能随意选择其他菌种。

　　很多菜农棚里根结线虫或者死棵发生严重，就想在闷棚前使用淡紫拟青霉、厚垣轮枝菌等为主的微生物杀线剂和枯草芽孢杆菌、放线菌等以防病为主的生物菌剂，这是行不通的。因为自然界的多数菌种对高温敏感，高温闷棚就是利用这个原理杀灭病原菌，若菌种选择不合理，闷棚开始时施入土壤的生物菌就被杀灭，起不到应有作用。

　　闷棚后

　　闷棚之后，经过高温的杀灭作用，土壤中的微生物大量减少，不管是有害菌还是有益菌，都被高温大量杀灭。此时，土壤处于“空白”阶段，土壤微生态被完全破坏，菜农应该及时补充有益菌种，否则一旦病原菌先行传入，缺少了有益菌的抑制作用，病原菌会更快地繁殖起来，导致闷棚后病害发生更重。

　　因此，闷棚结束后，菜农应该在棚内普施生物菌剂，尤其是枯草芽孢杆菌、木霉菌等防病为主的有益菌种，让有益菌提前占据土壤空间，抑制病原菌增殖，巩固闷棚的效果。